一般来说，公司会按照员工应纳税所得额来计算并扣除税款。因此，具体情况还需要根据当地国家或地方税法规定来执行。同时，公司也需要合法合规地缴纳相关的社会保险费用。
公司工资扣税是根据国家相关税法规定进行的。一般来说，公司会按照员工应纳税所得额来计算并扣除税款。以下是一般情况下公司工资扣税的流程：
1. 确定税前工资：公司根据员工的合同或协议，确定员工的税前工资数额。
2. 确定个人所得税级别：根据国家相关税法规定的个人所得税税率表，确定员工应纳税所得额所属的税率级别。
3. 扣除起征点：根据国家相关税法规定的起征点，确定员工是否需要缴纳个人所得税。如果员工应纳税所得额低于起征点，可能不需要缴纳个人所得税。
4. 计算应纳税所得额：将员工的税前工资减去个人所得税起征点，得到员工的应纳税所得额。
5. 计算税款：根据确定的税率级别，对应纳税所得额应缴纳的税款。
6. 扣除税款：将计算出的税款从员工的税前工资中扣除，得到员工的税后工资。
注意：以上是一般情况下的公司工资扣税流程，根据国家和地区不同，税法规定也会有所差异。因此，具体情况还需要根据当地国家或地方税法规定来执行。同时，公司也需要合法合规地缴纳相关的社会保险费用。
